多酶清洗液的使用方法通常包括以下步驟：
稀釋。根據需要清洗物品的污染程度，將多酶清洗液稀釋。稀釋比例通常在100到300倍之間，具體取決於污染程度。例如，對於嚴重污染的物品，可以使用較低的稀釋比例（如1:100），而對於污染較輕的物品，可以使用較高的稀釋比例（如1:300）。
浸泡。將需要清洗的物品浸泡在稀釋後的多酶清洗液中。浸泡時間一般在2到10分鐘之間，具體時間可以根據物品的污染程度和所需清洗效果來調整。如果物品污染較輕，可以適當縮短浸泡時間；如果污染較重，則應延長浸泡時間。
清洗。浸泡後，用清水將物品徹底清洗乾淨。這一步驟有助於去除多酶清洗液殘留，並確保清洗效果。
消毒處理。對於需要消毒的器械，應先使用多酶清洗液清洗，然後使用清水沖洗乾淨，並乾燥後再進行消毒處理，以防止蛋白質變性，避免凝固和粘結。
此外，使用多酶清洗液時應注意以下幾點：
避免直接接觸皮膚和黏膜，如果不慎接觸，應立即用大量清水沖洗。
操作時應佩戴手套和眼罩，以保護個人安全。
多酶清洗液應現配現用，不宜重複使用。
適宜的使用水溫在20℃到50℃之間，水溫越高，清洗效果通常越好。
使用後應旋緊瓶蓋，妥善保存。
對於特殊材質的器械，如需用戊二醛消毒的器械，應先使用多酶清洗液清洗，然後使用清水沖洗乾淨，並乾燥後再進行消毒處理。
使用超音波清洗時，多酶清洗液的浸泡時間一般為5到10分鐘。