手印的用途主要包括以下幾點：
在法律和金融檔案中，手印被用作身份驗證和簽署檔案的一種方式，尤其在一些情況下，當使用傳統簽名不方便或不實用時，如兒童、文盲或身體障礙者。
在醫學領域，手印可以用於診斷和治療。例如，某些手印練習被認為可以養生和治病，包括排毒、養肝、補腎、健脾胃等效果。
在刑事偵查中，手印痕跡是犯罪現場常見的一種證據。通過分析手印，調查人員可以判斷案件性質、犯罪人數、犯罪過程，甚至識別罪犯的個人特點，從而縮小偵查範圍或直接查明罪犯。這種分析基於手印的乳突線花紋特徵。
在現代科技中，手印也被廣泛套用於安全領域，如手機解鎖、防盜門鎖等。這些套用通常依賴於指紋識別技術。
此外，手印在某些宗教或精神實踐中也有其意義，例如瑜伽或冥想中使用的特定手印姿勢，旨在達到身心平衡或特定的精神狀態。