拜文昌帝君的方法主要包括以下步驟：
準備階段。選擇一個乾淨整潔的場所，如家中的書房或客廳，或寺廟中的文昌殿。準備鮮花、水果、香燭等供品，以及文昌帝君的神像或畫像。
祭拜儀式。首先，點燃香燭，向文昌帝君行三鞠躬禮。然後，將供品擺放在神像或畫像前，再次行三鞠躬禮。接著，默念自己的祈求，如希望文昌帝君保佑自己學業有成、未來能夠出人頭地等。最後，再次行三鞠躬禮，祭拜儀式結束。
焚香禮拜。在文昌帝君聖誕之日（農曆二月初三），有條件的在家中設定一個供桌，桌上要供奉文昌帝君畫像或帝君的聖位，聖位書寫：「談經演教消劫行化更生永命天尊」。焚香禮拜帝君，祝禱心願，後念誦文昌寶誥：「志心皈命禮。不驕帝境，玉真慶宮。現九十八化之行藏，顯億千萬種之神異。飛鸞開化於在在，如意救劫以生生。至孝至仁，功存乎儒道釋教。不驕不樂，職盡乎天地水官。功德難量，威靈莫測。大悲大願，大聖大慈。九天輔元，開化主宰，司祿職貢舉真君，七曲靈應，保德洪仁大帝，談經演教，消劫行化，更生永命天尊。」寶誥可以念誦十遍、或百遍、或隨意多念，自有帝君庇佑。
還願。如果祈禱的事情成真了，人就要還願，如不還願會損害自身的陰德，而一個人的陰德有損，會讓自己事事不順。
需要注意的是，在祭拜過程中要保持心誠則靈的心態，不可心存疑慮或敷衍了事。只有真心誠意地祈求，才能得到文昌帝君的庇佑和加持。