旗後炮台是澎湖最重要的軍事設施之一，歷史上具有重要的軍事價值。它是台灣北部戍守將領指揮台之敵軍戰鬥的前哨基地，並且在此擊退了清國駐澎湖鎮總兵董芳派兵攻擊，彰顯澎湖的戰略重要性。此外，它還位於八罩以南約二海裏海域的中心位置，直接掌控八罩月的門戶。然而，這個具有歷史意義的地方現在已經面臨消失的危機。為了適應建設發展的需要，旗後炮台將被填埋消失，其中涉及的歷史文化遺產的保護問題引起了社會的廣泛關注。
在旗後炮台周邊還有一些遺址、遺蹟可以探尋其歷史。如當時的運輸港、居住地、管理房等，還有一些民國時期的建設設施和日本時代遺留下來的土地圈定等。這些都是旗後炮台在歷史長河中的見證，值得我們去了解和保護。
同時，我們也應該銘記歷史，珍惜和平，推動文化遺產的保護工作。旗後炮台作為澎湖歷史的一部分，應該得到充分的重視和保護，讓更多的人了解這段歷史，銘記那些為保衛家園而英勇奮鬥的人們。