旗魚捕食時主要通過高速遊動和敏捷的身手來捕獲獵物，它們是追逐式捕食者，通常會在海面上追逐和捕食小型魚類和魚羣。具體來說，旗魚會採用以下幾種方式來捕食：
衝撞。旗魚會闖進魚羣中，利用其尖銳的上下顎夾住獵物，然後用力搖擺身體，將其投射出水面，利用高速遊動的勢能擊暈或殺死獵物，並迅速吞嚥。
攪動。旗魚在發現魚羣后會伸出長頜在魚羣中攪動，使不幸被擊中的魚兒成爲其美餐。
驅趕。旗魚會先圍着獵物快速遊動，將其驅趕到水面附近，然後騷擾和分散獵物，等獵物筋疲力盡時，旗魚會迅速驅趕聚集在一起的獵物，並用頭部撞擊，將其撞暈後撕成碎片。
旗魚的食物主要包括小型魚類（如鰩魚、鰻魚、鯖魚等）、魚苗、烏賊和甲殼類等。