木耳的處理方法主要包括以下幾個步驟：
泡發。將木耳放入冷水中泡發，泡發時間根據季節不同而變化，夏天需要4到6小時，冬天需要8到10小時。使用溫水泡發可以加速過程，但水溫不宜過高。在泡發過程中，每2小時換一次水，以保持水質清潔。
清洗。首先，去掉木耳的根蒂部分，這有助於去除雜質和沙土。然後，可以使用加有少量鹽、小蘇打、白醋的水輕輕搓洗木耳，以幫助去除農藥殘留和殺菌。加入澱粉輕輕揉搓也是一箇有效的方法，可以幫助去除木耳表面的粘液和雜質。
烹飪。烹飪前，先用開水焯煮木耳2到3分鐘，以去除卟啉等可能的有害物質，同時使木耳更加爽滑。
此外，根據不同的食譜需求，可以對木耳進行進一步的加工，如撕成小塊、加入調味料等。處理好的木耳可以用於各種烹飪，如涼拌、炒食等。在處理木耳時，注意要輕柔，避免過度用力損壞木耳的質地和口感。