李士群的死因在歷史上存在不同的說法和爭議。根據可用信息，可以總結如下：
初步報告：最初，李士群的死因被報告為因患吐瀉症不治身亡。這一說法由於李士群的年輕和健康狀況而受到質疑。
毒殺說：
一種說法是李士群被日本軍方新研製的一種特殊毒藥所殺。
另一種說法指出，李士群實際上是死於一種名為"阿米巴菌"的病毒，這一說法暗示了有預謀的毒殺行為，涉及漢奸熊劍東和日本上海憲兵隊特高科科長岡村中佐的合謀。
妻子與他人的嫌疑：
李士群的妻子葉吉卿被懷疑與情夫儲麟蓀合謀毒殺李士群。
另有說法提到，李士群的死可能與日本人的直接責任有關，包括懷疑葉吉卿、儲麟蓀、余愛珍等人的涉案。
歷史背景：
李士群在南京淪陷後，與日本間諜川島芳子勾結，這一行為可能與其最終的命運有關。
他的死因成為了歷史上的一個謎團，被掩埋在歷史的塵埃中。
綜上所述，李士群的死因涉及複雜的政治、軍事和個人關係，至今仍存在爭議。不同的說法和證據使得他的死因成為一個難以確定的歷史之謎。