愛新覺羅·毓鋆的著作主要包括：
《毓老師說論語》：該書是2016年3月中信出版社出版的圖書，基於毓老師在奉元書院講述《論語》的內容整理而成。它通過打通《論語》、《大學》、《中庸》、《春秋》等經籍，闡明了中國古典思想的精髓，並以平視的眼光解讀孔子，還原了孔子活潑、生動的本來面貌，使讀者能夠怡然領會儒家思想的美與智慧。
《毓老師說四書》：這套書籍包括《毓老師說大學》、《毓老師說中庸》、《毓老師說論語》、《毓老師說孟子》，是根據毓老師課堂講授「四書」之筆記整理而成，為學習儒家經典提供了豐富的資源。
《一代大儒愛新覺羅·毓鋆》：由許仁圖編著，該書講述了毓鋆的生平和學術成就，包括他在台灣民間講學六十餘年的經歷，以及他的眾多弟子和影響。
除了上述著作外，毓鋆還講解了兵學經典「武經七書」之《吳起兵法》《太公兵法》，以了解古代用兵、治國之道，並汲取經典兵學思想的精髓。此外，他的經學著作還包括《讀左傳隨筆》一卷、《春秋大事表補》二卷，以及在詩詞文書方面的成就，如《潛子文鈔》四卷、《潛子駢體文鈔》四卷、《潛子詩鈔》十六卷、《潛公詩話》二卷五十五則等。
綜上所述，愛新覺羅·毓鋆的著作豐富多樣，涵蓋了經學、兵學、詩詞等多個領域，展現了他作為一代大儒的深厚學術造詣和廣泛影響。