水晶豆腐的製作方法有多種不同的版本，以下是幾種常見的製作方法：
傳統口味。將豆腐搗成泥，雞脯肉剁成茸，香蔥、生薑切成末，青豆焯水後瀝乾。將這些材料與豆腐泥、雞茸、香蔥末、生薑末、精鹽、料酒、白鬍椒粉、味素、雞蛋清和水澱粉混合，攪拌均勻後製成丸子。將丸子炸至變色後撈出，再用高湯、精鹽和白鬍椒粉燒開，放入豆腐丸子和青豆，用水澱粉勾芡，最後加入雞油即可。
蝦乾瑤柱版。將蝦乾和瑤柱泡發後用熱油爆香，倒入泡蝦乾和瑤柱的水，加入鹽、雞粉和生粉調成汁。將豆腐蒸熟後切成塊，撒上蔥花，最後淋上做好的配料即可。
瓊脂版。製作豆漿和番茄汁。使用蘋果濃縮汁、瓊脂和豆漿按1:1:100的比例混合，煮豆漿並快速成型。加入白糖、煉乳和瓊脂，倒入模具中靜置至凝固後脫模裝盤。
豬皮凍版。豬皮清洗乾淨後切成細絲，加入三倍的水煮製成豬皮凍。將凍倒入模具中，涼置至凝固。
這些方法各有特色，可以根據個人口味和食材的可用性選擇適合的方法。