河豚體內之所以含有劇毒，主要是因爲它們攝入了含有河豚毒素的食物或者外部環境中的有毒物質。河豚毒素是一種非常強的神經毒素，能夠阻止鈉離子通過細胞膜，從而影響神經細胞的正常功能，導致肌肉麻痹，甚至呼吸停止。
河豚毒素的產生有兩種主要理論：
自身產生說。河豚在孵化過程中體內河豚毒素量會增加。
外部攝入說。河豚通過食用含有毒素的食物（如某些海洋藻類、細菌等）或者在人工飼養環境中餵食含有毒素的飼料，從而在體內積累毒素。
此外，河豚的某些部位，如卵巢、肝臟和血液，含有更高濃度的毒素。因此，在處理河豚時需要特別注意，以避免食用含有毒素的部位，導致食物中毒甚至死亡。