在深圳，為公交卡（深圳通卡）充值有多種方式：
人工充值。可以在深圳通客服網點、捷運站、有深圳通標誌的便利店等進行充值。例如，捷運1至5號線沿線站點的售票廳、7-11便利店、美宜佳、百里臣、百里匯、萬店通等。
24小時自助充值。自助充值機主要設在捷運沿線、公共場所、業務銀行網點等。目前自助充值機已輔設了4450台，包括銀聯「易辦事」自助終端機、中行自助充值設備、交行「交銀自助通」、捷運站內自助售卡充值設備等。
空中充值。可以通過嘟嘟寶網上充值、鵬淘APP充值等服務進行充值。
深圳通卡首次充值最低限額為50元，每次充值額為50元整數倍，儲值額最高不得超過1000元。如果卡片有透支情況，充值時將首先償付透支款。深圳通卡內儲值額以深圳通中央結算系統的記錄為準。持卡人應根據自身需要適量充值並妥善保管。