溴硝醇具有較強的毒性，對環境和人體健康都可能造成危害。
溴硝醇能影響植物生長，導致葉片腐爛和生長減緩，還會影響作物的光合作用和養分吸收，導致作物產量減少，對土壤和地下水造成污染。此外，溴硝醇對眼睛、皮膚和黏膜有刺激性，大量使用可能引起先天性異常並對環境造成危害。
在急性毒性測試中，溴硝醇對大鼠的口服LD50值在300至2,000毫克/公斤（體重）之間，對兔眼睛有輕微的刺激性，對兔皮膚無刺激性，對豚鼠皮膚無致敏性。在針對小鼠的急性毒性測試中，LD50值為222至266毫克/公斤體重，表明其對小鼠也具有中等毒性。