烏魚子的保存方法有幾種：
陰涼乾燥處保存。適用於短期存放，在陰涼乾燥的地方放置即可。
冷藏保存。將烏魚子切成每餐所需的量，用保鮮膜包裹後，外層再包報紙以隔絕異味，可以放入保鮮盒中冷藏，這樣的保存效果更佳。冷藏的烏魚子最好在拆封後30天內食用完畢，以保持最佳風味。
冷凍保存。對於更長時間的保存，可以將烏魚子放入密封袋中，排除袋內空氣後封緊，再放入冰箱冷凍室。這樣處理後，烏魚子可以保存較長時間，甚至達一年，但爲了防止烏魚子凍傷，建議使用多層報紙或廚房紙巾包裝後再放入冷凍庫。
此外，在解凍烏魚子時，建議不要使用室溫解凍或直接放入微波爐或烤箱的方法，而是應該將其放置在冰箱冷藏室中靜置約12小時慢慢解凍，以保持其品質和口感。