忒修斯之船的結局因不同的故事版本而有所不同。以下是兩個版本的結局概述：
日劇《忒修斯之船》結局：
主角在經歷了一系列複雜的事件後，試圖揭露真相併拯救家人。他在關鍵時刻穿越回未來，但發現家人遭受了更大的悲劇。他決定尋找新的證據來為父親翻案，最終揭露了真兇，但自己也遭受了傷害。
古希臘神話中忒修斯的故事結局：
忒修斯從哈得斯的地獄歸來，成為了一位嚴肅的老人。他聽到海倫被救回後感到釋然，但國內因叛亂而混亂。儘管忒修斯試圖用武力鎮壓叛亂，但最終失敗。在絕望中，他決定放棄無法控制的城市，並前往斯庫洛斯島尋求避難。不幸的是，他在那裡被誤認為敵人而推下懸崖，最終跌入大海，雅典人在他死後不久便將他遺忘。
這兩個結局展示了忒修斯這一角色在不同敘事中的不同命運和結局。日劇版本提供了一個現代故事情節，而古希臘神話則講述了忒修斯的經典故事。