狗狗使用肺心康可能會產生一些副作用。這些副作用包括心跳加快、口渴、尿頻、增加腎臟負擔、胃酸分泌增加、抑制子宮收縮等。此外，長期服用肺心康後突然停藥可能會導致症狀加劇，這種停藥反應被稱為反跳現象。在心血管方面，肺心康的不良反應可能表現為心動過緩、低血壓、四肢冰冷等，嚴重時可能導致心力衰竭和傳導阻滯。
需要注意的是，肺心康對β2受體有阻斷作用，可能會增加氣道阻力並誘發哮喘，因此哮喘及慢性喘息性氣管炎患者不宜使用。此外，肺心康與某些藥物如異丙腎上腺素、單胺氧化酶抑製劑或能增強腎上腺素功能性質的藥物合用時，可能會減弱其療效或產生嚴重的副作用。
對於腸胃不好的狗狗，由於肺心康的藥性強，應慎用。懷孕的狗狗、胃潰瘍的狗狗和患有加速性節律異常的狗狗不可以使用肺心康，否則可能會造成生命危險。因此，狗狗使用肺心康應在獸醫的指導下進行，嚴格按照藥量用法餵食，每十公斤可以吃100毫克，每天2~4次。