獨孤般若選擇嫁給宇文毓的原因主要是出於對家族榮辱的考慮和對“獨孤天下”預言的執着。她作爲家中的長女，希望實現這一預言，因此不遺餘力地想幫助自己的夫君登上王位。儘管她與宇文護之間有感情，但她意識到宇文護已經娶過清河郡主，這使得她難以成爲宇文護的正妻或皇后。相比之下，宇文毓雖然性格懦弱，但對獨孤般若情深意重，且身份不低，因此獨孤般若認爲通過扶持宇文毓登位，可以實現自己的目標。
此外，獨孤般若的生母是太原郭氏，父親是八大柱國之首，這使得她在權傾朝野的宇文護面前保持自信，認爲自己的出身不遜色於宇文護。因此，在權衡了各種因素後，獨孤般若決定犧牲個人幸福，選擇嫁給宇文毓，以實現“獨孤天下”的預言。