甜菜根可以通過多種方法進行保存，以延長其新鮮度和可用性：
冷藏保存。將甜菜根存放在冰櫃的蔬菜室中，可以使用塑膠袋來維持其濕度，這樣處理後的甜菜根可以保存大約2至3周。
冷凍保存。將甜菜根切成適當大小的塊或片，進行焯水後迅速冷卻，並瀝乾水分，然後裝入密封袋或冷凍盒中，放入冷凍室可以保存更長時間。
曬乾保存。將甜菜根放在通風良好、陽光充足的地方晾乾。晾乾後的甜菜根可以保存幾個月，若存放在乾燥、陰涼處則保存時間更長。
醃製保存。將甜菜根切片或切絲，加入鹽、糖、醋等調味料攪拌均勻後，放入密封容器中冷藏，可以延長甜菜根的保質期，通常可以保存數周至數月。
製作罐頭。將甜菜根煮製、裝罐，並浸泡在混合了白醋、糖、甜菜水和鹽的溶液中，然後冷藏保存，這樣可以保存約一年。
無論採用哪種保存方法，都應確保甜菜根存放在乾燥、陰涼的環境中，並定期檢查以避免腐爛或變質。