生態系統的功能主要包括以下幾個方面：
生物生產。生物生產涉及將太陽能轉化爲化學能，即有機物質的生產。這一過程包括植物性生產和動物性生產，兩者通過食物鏈和食物網相互聯繫，進行能量和物質的交換。
能量流動。生態系統的能量主要來源於太陽能，通過食物鏈在系統內傳遞和耗散。能量流動是單向的，逐級遞減，從生產者傳遞到消費者，再到分解者。消費者只能獲得傳遞到其營養級的能量的10%左右，其餘部分以熱能的形式散失到環境中。
物質循環。生態系統的物質循環涉及生物羣落與無機環境之間的物質交換。這包括組成生物體的基礎元素（如碳、氮、硫、磷）的循環，以及有毒物質的全球性循環，如通過生物地球化學循環進入生態系統的氣體污染物。
信息傳遞。信息傳遞包括物理信息、化學信息和行爲信息，這些信息在生態系統中起着至關重要的作用，如幫助生物適應環境變化和進行種羣間的交流。
此外，生態系統還爲人類提供了必需的物質資源和良好的生存條件，如維持生物多樣性、改良土壤、涵養水源、調節氣候等，這些功能對人類與環境的服務都至關重要。