在遊戲中，石果的採集可以通過以下步驟完成：
找到石果生長的位置：石果通常生成於地下洞穴的石果灌木叢中。玩家可以通過留意環境中的特殊石頭來發現石果的生長點。
採摘石果：玩家可以直接通過鼠標右鍵點擊採摘石果。每個灌木叢會掉落2至3個石果。
使用工具：如果沒有特殊工具，如挖石鎬，玩家將無法採集到石果。使用挖石鎬可以在正確的地方輕鬆採集到石果。
月面洞窟中的石果：在月面洞窟中，當地震發生後，玩家也可以收集到隨機掉落的石果。
石果的處理：石果無法直接食用，但可以將其放在地上，使用鶴嘴鋤、火藥、蛞蝓粘液、天氣風向標、亮茄炸彈等手段將其破開。破開後，有65%的概率獲得成熟石果，34%的概率獲得石頭，1%的概率獲得發芽的石果。