石燕的吃法有多種，以下是幾種常見的吃法：
煎汁內服：將石燕搗碎加水煎汁，取湯汁與粳米煮粥食之，早、晚空腹食。
磨汁服用：石燕可以磨汁服用，服用時要遵循醫囑，不要自行增加或減少藥量。
泡酒食用：石燕去殼，大火炒後泡酒，有益精氣、強意志的作用，可用於體質虛弱、精神疲倦、思維遲鈍、健忘。和人參、熟地黃、生地黃等中藥配伍，有補腎填精、益髓健腦的功效，可用於改善記憶力減退、腰膝酸軟、面色蒼白、神疲乏力、手足不溫等。
燉湯食用：石燕一開四，瘦肉切丁飛水，加泡石斛的水和純淨水，高壓鍋氣開12分鐘，也可以用燉鍋慢慢燉，鹽調味即可。石燕燉好肉不爛，可以撈起來點醬吃。
以上吃法均需注意，石燕的使用應遵循醫囑，不要自行增加或減少藥量。