窖泥在釀酒過程中起著至關重要的作用，它不僅是封窖和製作窖底的黏土，促使糧食在窖池內無氧發酵成酒，還是釀酒微生物的載體，為微生物提供生長的環境。
窖泥中含有豐富的微生物，這些微生物在發酵過程中產生多種風味物質，如丁酸、己酸和己酸乙酯等，為醬香型白酒的特色風味提供支持。在濃香型大麯酒的生產中，窖泥的質量直接影響到酒的質量，因為窖泥中的氮、磷、鉀、腐殖質等成分能為微生物的生長和繁殖提供營養。
隨著時間的積累，窖泥中自然累積了大量對發酵有益的微生物，形成了一個微生態菌群體系，這對提高酒的質量和產量至關重要。而且，隨著研究的深入，現在也開始注重人工窖泥的培養，以最佳化濃香型白酒的生產。