粉晶的淨化有多種方法，以下是一些常用的方法：
鹽水淨化。將粉晶浸泡在鹽水中，持續三到四個小時。這種方法可以有效消除粉晶的靜電，但應注意，不宜頻繁使用，大約每三個月淨化一次，以免影響粉晶的能量頻率。使用的鹽最好是御守鹽，因爲它在消除負能量的同時，對正能量有保護和增強的作用。
自然消磁法。利用大自然的力量進行淨化。例如，在月圓或陽光強烈的天氣下，將粉晶放置在室外。
純淨水浸泡法。將粉晶放置在純淨水中浸泡，加入適量的海鹽效果更佳，一般浸泡4~5個小時。
精油消磁法。使用天然精油（如檀木精油）擦拭粉晶表面，以達到淨化效果。
活水源沖洗法。利用活水源（如小溪、瀑布）沖洗粉晶，一般沖洗15~20分鐘即可。
需要注意的是，粉晶不宜長時間在陽光下曝曬，因爲這可能會導致顏色褪色。