系統整合是一種將多箇獨立系統進行統一管理、合併，使之成爲一箇兼具各個子系統功能的新系統的過程。
這個過程強調各個系統之間的信息互通和相互協作，其目的是實現整體的優化，有效利用資源，提高效率和效益，同時也有利於環境保護和經濟增長。在不同的領域，系統整合有着不同的應用，例如在企業管理和信息技術領域，系統整合可能涉及將不同的軟件、硬件和應用程序組合成一箇完整的系統，以實現企業運營的高效和協同。在系統內整閤中，優化系統結構和提高系統功效是重點，而在系統間整閤中，則是突破系統的自身侷限，尋找外部資源，彌補系統內部的不足或缺陷。