紅毛丹和荔枝在多箇方面存在顯著差異：
外形。荔枝的外觀爲圓形或橢圓形，果皮上有紅色的或綠色的凸起，觸感粗糙；紅毛丹的外觀也是圓形或橢圓形，但果皮上的觸鬚狀絨毛更柔軟和密集，通常呈現紅色或黃色。
口感。荔枝的果肉非常甜，鮮美多汁，果核較大；紅毛丹的果肉相對較薄，口感更加清爽，味道微酸帶甜，果核較小。
植物學特徵。荔枝屬於荔枝屬植物；紅毛丹屬於韶子屬的植物。
產地。荔枝原產於中國南方，主要分佈在廣東、福建、廣西、海南等地；紅毛丹原產於馬來西亞和印度尼西亞，現在主要在東南亞各國種植，在美國、夏威夷和澳大利亞也有栽培。
生長環境。荔枝和紅毛丹都喜歡溫暖溼潤的環境，但荔枝需要充足的陽光和水分，而紅毛丹則需要避免強烈陽光直射和乾燥氣候。
成熟期。荔枝的成熟期主要在夏季；紅毛丹的成熟期主要在春季和夏季。
喫法。荔枝可以直接剝開食用，喫完果肉吐出果核即可；紅毛丹剝開後還需要撕掉果肉表面的保護膜纔可以食用。
價格。紅毛丹在國內種植較少，主要依靠進口，價格較貴；荔枝在中國南部有很多產地，價格相對便宜。