自製水草肥料可以通過多種配方來實現，以下是一些常見的配方：
化學肥料配方。硝酸鉀21g、硫酸鉀41g、七水硫酸亞鐵(綠礬)8.053g、硫酸鎂15.5g、硼酸1.66g、硫酸錳1.17g、鉬酸鈉0.02g、五水硫酸銅0.05g、七水硫酸鋅0.255g、二胺四乙酸二鈉10g。以上藥品稱量後配以1000ml溫水調勻密封陰涼處保存，定期施用，量不宜過多。
簡易肥料配方。硫酸鉀8.7g、7水硫酸鎂4.0g、硼酸0.03g、7水硫酸亞鐵2.68g、4水硫酸錳0.04g、7水硫酸鋅0.18g、5水硫酸銅0.05g、2水鉬酸鈉0.01g、乙二胺四乙酸二鈉3.9g。
此外，還有許多其他自然肥料配方，如使用紅蛋殼、葉子、烤制魚肉、綠藻、廚餘垃圾等製作肥料，這些肥料含有豐富的營養成分，如鈣、鎂、鉀、氮、磷和鉀等，有助於水草的生長。每種肥料的使用方法和效果可能有所不同，因此在嘗試新的肥料配方時，應先了解其特性和適用範圍。