芝士通心粉的做法有多種，以下是幾種流行的做法：
意式培根芝士通心粉。首先將水燒開，加入鹽和通心粉煮5分鐘，同時，在另一個鍋中加熱橄欖油，加入洋蔥炒至金黃色，再加入切好的意式培根炒至焦脆，然後加入麵包糠和煮好的通心粉炒勻，最後加入一些Parmesan乾酪和芝士通心粉攪拌至完全混合。
白醬芝士通心粉。首先將通心粉煮約十分鐘，然後濾出沖涼水冷卻，同時製作白醬（Bechamel醬），將油麵炒熟後，慢慢倒入熱牛奶，中火攪勻，再加入芝士攪至順滑，最後將通心粉倒入白醬中攪拌均勻，盛入烤碗中，撒上一些芝士和麵包屑，放入預熱至180度的烤箱烤約25分鐘。
番茄醬焗芝士通心粉。先煮至八成熟的通心粉過冷水瀝乾，在炒鍋中爆炒洋蔥、彩椒和蔥白，加入番茄醬和食鹽攪拌均勻，然後將通心粉裝盤，鋪上彩椒和芝士條，放入預熱至200度的烤箱焗約10分鐘。
牛肉芝士通心粉。在炒鍋中加入橄欖油，炒洋蔥至軟，再加入絞牛肉、番茄膏、水或高湯等，煮至通心粉熟透，最後加入車打芝士。
烤箱焗芝士通心粉。在炒鍋中炒洋蔥、蒜、卡宴辣椒粉和火腿腸，加入奶油或牛奶和番茄醬，然後加入通心粉，最後撒上乳酪碎，放入預熱至220度的烤箱烤約10分鐘。
這些做法各有特色，可以根據個人口味選擇適合的做法。