打孔菩提子的步驟如下：
準備工具。選擇合適的菩提子，直徑在1~1.5cm左右，根據需要的孔徑選擇相應規格的鑽頭（例如1.5mm、2mm、2.5mm、3mm等），對於大量打孔，可以使用打眼機。
表面處理。使用細沙或打磨粉清洗菩提子表面，去除雜質和油脂。
定位和標記。在菩提子表面標記出需要打孔的位置，可以使用鉛筆或白色筆做標記。
固定和打孔。將菩提子固定在打孔台上，避免表面被夾傷，先用鑽頭在菩提子中心位置打一個向下的孔，深度約為菩提子的1/3，然後沿著這箇中心孔使用對應規格的鑽頭打出所需的孔徑。
孔口處理。用細砂紙打磨孔口，使其光滑平整。
檢查和調整。在打孔過程中不斷檢查和調整鑽頭的位置，確保孔徑垂直且美觀。
注意事項。打孔時要確保菩提子固定穩定，避免移動或破裂；使用電動工具時，要特別注意安全，避免菩提子或工具飛出造成傷害。
根據不同的菩提子類型（如金剛菩提、千眼菩提等），打孔方法可能會有所不同，但基本步驟和注意事項是相似的。