菲牛蛭和日本醫蛭各有其獨特的特性和優勢，選擇哪個更好取決於具體的套用和需求。
菲牛蛭是一種個體較大的水蛭品種，其水蛭素的活性含量非常高，是日本醫蛭的14倍，寬體金線蛭的73倍。菲牛蛭的抗凝血活性非常強，在抗凝血酶作用方面強於日本醫蛭。菲牛蛭的唾液分泌量最多，因此所含的水蛭素量也最多，是生產天然水蛭素的好品種。
日本醫蛭則是一種具有醫藥級的水蛭種類，具有顯著的藥用功效。它的抗血小板聚集和抗凝血作用非常強，藥效遠大於其他品種。日本醫蛭在醫用及藥用實踐方面有諸多報導，如套用於緩解患者靜脈淤血狀況，促進血液循環等。
總的來說，如果需要高活性的水蛭素，菲牛蛭可能是更好的選擇；如果需要強效的抗血小板聚集和抗凝血作用，日本醫蛭可能是更合適的選擇。