蘇丹長期存在戰爭的原因主要涉及民族、宗教、文化和政治等方面的差異與矛盾。具體來說：
民族和宗教矛盾。蘇丹是一箇多民族和多宗教的國家，境內居住着來自不同民族和宗教的人羣，這些羣體之間存在着歷史上的矛盾和紛爭。民族和宗教之間的分歧和衝突成爲了武裝衝突的導火索。
政治不穩定。自蘇丹獨立以來，政權更迭頻繁，政治局勢不穩定。政治權力的爭奪和分配不公導致了各種政治派別之間的衝突。政府的腐敗和無能也使得人民對政府失去信任，進一步加劇了衝突的發生。
資源分配不公。蘇丹是一箇資源豐富的國家，擁有豐富的石油和其他自然資源。由於資源分配不公，導致了不同地區之間的資源爭奪。這些爭奪往往演變成武裝衝突，各方爲了爭奪資源而進行武力對抗。
地理位置重要。蘇丹地理位置重要，處於非洲和阿拉伯世界的交匯處。國際利益和地緣政治因素使得蘇丹成爲國際干預的焦點。國際組織和外國勢力的干預往往使得衝突變得更加複雜和難以解決。
此外，蘇丹內戰還包括南北蘇丹之間的歷史和政治差異、宗教政策偏向、以及經濟困境等因素。