蜂花粉的保存方法主要有以下幾種：
冷藏保存。將蜂花粉密封後放入冰櫃或冷庫中，最佳保存溫度在-1℃到-5℃之間。在更低的溫度下，蜂花粉可以保存幾年不變質，營養成分也不會流失。
常溫保存。首先確保蜂花粉足夠乾燥，然後使用較厚的塑膠袋密封，存放在乾燥通風的地方。在某些情況下，可以對蜂花粉噴灑95%的乙醇以進一步延長保質期，並避免光照，這樣可以維持蜂花粉的保質期在6到12個月。
除氧劑保存。使用除氧劑消除包裝袋或容器中的氧氣，這樣可以抑制微生物的生長，從而延長蜂花粉的保質期。
加糖保存。將蜂花粉與白糖按照2:1的比例混合，裝入密封容器中，並在表面覆蓋一層厚厚的白糖。這樣可以阻止空氣與蜂花粉接觸，從而延長其保質期。
此外，將蜂花粉與蜂蜜混合也是一種有效的保存方法。在這些方法中，冷藏保存可以最大限度地延長蜂花粉的保質期並保持其品質。