蝙蝠魚是一種雜食性魚類，其食物主要包括浮游生物、小魚、蝦肉、魷魚肉、紫菜等海藻。 蝙蝠魚也會喫人工餌料，尤其是經過訓練的蝙蝠魚對餌料的選擇不挑剔。此外，紅邊蝙蝠魚還能喫水中的浮游微生物、豐年蝦、魚蟲、水蚯蚓等。