螢光蛋白是一類能夠吸收短波長光並轉化為長波長光的蛋白質。
這種蛋白質最早是從水母中發現的，由約220~240個胺基酸組成，可在特定波長的激發光照射下發出不同顏色的螢光。螢光蛋白的發現和套用對現代生物學研究產生了重要影響，特別是在基因表達檢測和細胞內蛋白質定位方面。
科學家通過研究螢光蛋白的發光機制，發現了螢光共振能量轉移現象，並利用這一現象開發了多種顏色的螢光蛋白變體，擴展了其在生物醫學研究中的套用範圍。例如，綠色螢光蛋白（GFP）已被廣泛用於標記細胞和蛋白質，以非侵入式的方式觀察活細胞和生物體內的生命活動。此外，科學家還培育出了深紅色的螢光蛋白質，這種蛋白質發出的光具有極強的穿透性，有助於監視活生物體的發病和康復過程。