購房違約金的計算主要依據房屋買賣契約的約定。契約中可以明確規定違約情況下需支付的違約金數額或損失賠償的計算方法。如果契約中有擔保條款，違約方可能還需承擔解除契約及賠償損失的責任。違約金的數額應合理，不得過高或過低。如果約定的違約金低於實際損失，法院或仲裁機構可根據當事人請求增加；反之，如果約定的違約金過高，法院或仲裁機構也可根據請求適當減少。
具體到違約金的比例，這可能因契約而異。例如，有的契約可能約定買方要求解除契約時，賣方需按契約總金額的30%支付違約金；或者買方要求繼續履行契約時，賣方需按契約總金額的10%支付基礎違約金，並每延遲一天過戶/交房，按契約總金額的萬分之三支付附加違約金。
如果契約中沒有明確約定違約金的計算方法，可以根據已付房款的總額，參照中國人民銀行規定的金融機構計收逾期貸款利率的標準計算。例如，如果原告主張被告按年利率6%的標準支付逾期辦理權屬登記的違約金，且這一標準得到法院確認，那麼違約金的計算方法為：已付房款的總額×年利率6%×違約年份。具體的違約金數額應根據判決書的計算結果確定。
綜上所述，購房違約金的計算需要根據具體契約條款和法律規定來確定。