辣椒炭疽病的防治方法主要包括農業防治和化學藥劑防治。具體如下：
農業防治。選用抗病性強的辣椒品種，合理施肥、澆水、修剪，避免過度修剪，及時清理病葉、殘葉，定期通風換氣，降低棚內濕度，創造不利於病害發生的環境條件，選擇無病果留種，及時清理田間病殘植株，合理密植、注意田間通風透光，改善株間小氣候，進行高墒雙行或單行栽培，增強通風透光，注意排水，適時採收，采後及時清潔田園，進行土壤補鈣，每畝撒施熟石灰100~150千克後打地理墒，殺滅或抵制土壤中的病原菌，調整土壤pH值。
化學藥劑防治。使用10%的苯乙甲環唑，20到30克兌30到40斤水噴霧，或使用15到20克一桶水的咪鮮胺錳鹽，或使用苯甲丙環唑、吡唑代森鋅等藥劑進行噴施，建議交替使用不同藥劑，避免產生抗藥性，在發病初期，可以使用波爾多液、石硫合劑等殺菌劑噴霧，每隔7到10天噴霧一次，連續噴霧2到3次。另外，可以在播種前用50%多菌靈可濕性粉劑500倍液浸種1小時，或用4.8%苯醚·咯菌腈懸浮種衣劑按照藥種比1:200~250拌種。
這些措施可以有效地防治辣椒炭疽病。