清洗過濾棉的方法包括以下幾個步驟：
取出過濾棉。首先，需要關閉魚缸過濾器，以免對魚缸的生態環境造成影響，然後將其中的雜質清除乾淨，在拆卸過濾棉時要輕輕拆下，避免弄斷過濾棉內部的細菌和微生物。
沖洗。用清水沖洗過濾棉，將其中的污垢沖洗乾淨，注意水溫不要過高，以免過濾棉變形或者破損。如果是非常髒的過濾棉，可以用水龍頭沖洗，但流水不宜太大，否則容易把過濾棉的纖維結構破壞掉。
浸泡。可以將過濾棉放入含有洗滌劑的水中浸泡大約10分鐘，這樣可以去除過濾棉上的細菌和污垢。也可以使用鹽水或醋進行清洗，鹽水可以殺死過濾棉中的有害細菌和微生物，而醋可以去除水垢和污漬，同時中和氨氣和硝酸鹽，避免對水質產生影響。
再次沖洗。用清水徹底沖洗過濾棉，直到洗淨所有洗滌劑或鹽水，確保過濾棉變得乾淨清爽。
消毒。如果過濾棉上出現小蟲子，除了沖洗外，還需要用開水浸泡一會兒，以殺死細菌和防止蟲卵殘留。
放置。清洗好的過濾棉可以放在濾盒的下層，而之前鋪在下面的過濾棉則放在上層，這樣的過濾效果更好。同時，注意不要用力搓洗過濾棉，以免破壞其纖維結構。
需要注意的是，如果過濾棉非常髒且難以清洗乾淨，考慮更換新的過濾棉可能更爲合適。