酶的活性中心是酶分子中能夠直接與底物分子結合併催化底物化學反應的部位。
酶的活性中心對酶的催化作用至關重要，它主要由兩個功能部位組成，結合部位和催化部位。結合部位使酶的底物結合到酶分子上，而催化部位則負責打斷底物的鍵或形成新的鍵，從而引發化學變化。活性中心通常由酶分子中在三維結構上靠近的少數幾個胺基酸殘基組成，這些胺基酸殘基在一級結構上可能相距很遠，甚至位於不同的肽鏈上。在空間結構上，這些胺基酸殘基通過肽鏈的盤繞和摺疊相互靠近。對於需要輔酶的酶來說，輔酶分子或其某些部分結構也是活性中心的重要組成部分。