醋酸乙酯對人體健康具有一定的危害。具體來說，它對眼、鼻、咽喉有刺激作用，高濃度吸入可能會引起進行性痲醉作用、急性肺水腫以及肝、腎損害。如果持續大量吸入，可能會導致呼吸痳痺。誤服者可能會出現噁心、嘔吐、腹痛、腹瀉等症狀，嚴重時甚至可能引起牙齦出血和濕疹樣皮炎。長期接觸醋酸乙酯可能會導致角膜混濁、繼發性貧血、白細胞增多等慢性影響。
如果不慎接觸到醋酸乙酯，應立即脫去被污染的衣物，用肥皂水和清水徹底沖洗皮膚。與眼睛接觸後，應提起眼瞼，用流動清水或生理鹽水沖洗。如果吸入，應迅速脫離現場至新鮮空氣處，保持呼吸道通暢。如出現呼吸困難，需要輸氧。如呼吸停止，應立即進行人工呼吸。誤食後應飲足量溫水，催吐。
需要注意的是，醋酸乙酯本身基本上是沒有毒性的，但是除了醋酸乙酯以外，你接觸到的另一些化學品有沒有毒性就不得而知了。因此，平時應多注意個人安全，不要隨意接觸有害物質，以免對身體健康造成影響。