鑑別黃水晶真假的方法包括：
觀察顏色。真正的黃水晶顏色通常為淺黃色或深黃色，且顏色均勻。假冒黃水晶顏色可能過於鮮艷，並有明顯色差。
檢查硬度。黃水晶硬度高，用尖銳物品划過表面不會留下痕跡。假冒黃水晶通常用玻璃或其他硬度較低材料製成，表面會有劃痕。
觀察光澤。真正的黃水晶表面光滑，具有強光澤。假冒黃水晶光澤較差，表面較粗糙。
觀察重量。黃水晶密度較大，手感重。假冒黃水晶手感較輕。
查看色帶和棉裂。真正的黃水晶色帶不規則，顏色有層次感。假冒黃水晶色帶規則，顏色統一。真正的黃水晶可能有輕微棉裂，但假冒黃水晶通常完美無瑕。
觀察孔道。真正的黃水晶孔道較小，四壁平整，可能有輕微崩口。假冒黃水晶孔道較規則或過大。
觀察內含物和瑕疵。在20倍珠寶放大鏡下觀察，天然黃水晶常有天然融入的氣液包含體、絮狀物、共生礦物等瑕疵。
光學鑑別。在偏光鏡下轉動黃水晶，真正的天然黃水晶有明暗變化，而假冒黃水晶沒有。
雙折射法。將黃水晶放在一根頭髮絲上，輕輕轉動，真正天然黃水晶能產生明顯的雙折射現象。
熱導檢測。使用熱導儀測試，真正的天然黃水晶能上升至黃色格，而假冒黃水晶不上升。
價格考量。非常乾淨且顏色濃郁的黃水晶價格極低時很可能是假的。