龍眼的保存方法有多種，主要包括：
冰箱保存。將龍眼放入保鮮袋或網裝袋，每袋裝幾十顆，足夠一家人一頓喫完的量。在保鮮袋上扎幾個小孔供水果呼吸，放入冰箱冷藏室，最佳的保存溫度在3到4攝氏度。注意不要放在冷凍室，以免影響口感和果肉質感。
曬乾保存。將龍眼曬乾後放在乾燥通風的地方，可以保存較長時間，但口感和營養成分可能會有所損失。
泡水保存。將龍眼放入水中浸泡，加入適量的鹽或檸檬汁，可以防止乾燥和氧化，延長保存時間。
真空保存。將龍眼放入真空袋中，抽出空氣，防止氧氣接觸，從而延長保存時間。
冷藏在蔬果保鮮室。將龍眼清洗乾淨並完全晾乾後，放入保鮮盒中，再放入冰箱的蔬果保鮮室。
製作成果醬、乾果等。將龍眼製作成果醬、乾果等，這樣可以延長保存時間，同時增加口感和營養價值。
除此之外，還可以選擇將龍眼燙煮後風乾，或者選擇成熟的龍眼並保持適宜的儲存溫度（大約2到6攝氏度）等方法進行保存。在保存龍眼時，還需注意避免受潮、避免接觸氧氣、避免高溫，以及注意季節變化和品種質量差異等因素。