在PKPM中進行建模的步驟大致如下：
建立模型資料夾。首先，在電腦中創建一個資料夾，用於存放模型檔案，並命名為工程名稱。
進入PKPM操作界面。打開PKPM軟體，選擇「檔案」選單，更改目錄至創建的模型資料夾，確認後進入操作界面。
輸入軸線。根據建築平面圖布置軸線，這是結構布置的基礎。在PKPM中，選擇「軸線網點」功能，進行正交軸線的編輯和確定。
布置柱子。柱子是結構的豎向構件，需要在節點處布置。使用「構建布置」功能，選擇「柱」選項，添加並定義柱的界面尺寸，然後布置到節點上。
布置梁。梁在軸線上布置，操作方式與布置柱子類似。定義梁的尺寸和位置。
生成樓板。樓板的生成可以隨後梁的布置進行。完成後，可以根據需要調整板厚，如果某些格線不作為樓板使用，可以設定樓板洞口。
輸入荷載。荷載包括面荷載（樓板）和線荷載（梁）。在軟體中，分別輸入恆荷載（紅色圖示）和活荷載（藍色圖示）。
設計參數設定。根據工程實際情況，填寫設計參數。
樓層組裝。根據樓層高度和層數進行樓層組裝，然後檢查整體樓模型。
分析設計計算。選擇SATWE進行結構分析和設計計算。
設計模型前處理。根據結構規範設定參數，確認後進行模型計算。
查看計算結果。根據配筋、文本查看等結果判斷模型是否合格，如有不合格部分需進行調整，直至模型滿足要求。
施工圖繪製。模型合格後，進入施工圖繪製模組，根據提示繪製梁板柱的施工圖。