Silent Hill 4故事內容大致如下：
主角砥柱因妹妹遭到惡魔獵手攻擊，隨後妹妹失蹤，而主角踏入Silent Hill調查，途中會遇到各式各樣的人和生物，並逐步揭示Silent Hill的秘密。故事中主角一行人遭遇了深不見底的深淵，而在深淵之下，主角見到了深淵之主——一個曾經試圖扼死自己妹妹的瘋子。與此同時，其妹銀次的幽靈也開始一直糾纏主角，並在主角遭受襲擊時救下主角。 這些元素都融入了遊戲的主線劇情中。
同時，怪物與物品設定，如透明人、流淚的臉、拉米、尼羅和辛賈等怪物的設定以及狂暴果實和毒素蘑菇等道具的出現，都為遊戲增加了恐怖的氛圍和深意。
總的來說，Silent Hill 4的故事內容豐富，恐怖氛圍渲染到位，值得一玩。