siRNA（小干擾RNA）的作用原理涉及到對特定基因表達的沉默，這一過程通過以下步驟實現：
外源性基因的整合與dsRNA的形成：
當病毒基因、人工轉入基因或轉座子等外源性基因隨機整合到宿主細胞基因組內，並在宿主細胞中進行轉錄時，會產生雙鏈RNA（dsRNA）。
Dicer酶的作用：
宿主細胞中的核酸內切酶Dicer將dsRNA切割成多個長度約為21至23個鹼基對的小片段RNA（siRNA）。
siRNA的解鏈與RISC的形成：
在細胞內RNA解旋酶的作用下，siRNA解鏈成正義鏈和反義鏈。反義siRNA與體內的一些酶（如內切酶、外切酶、解旋酶等）結合，形成RNA誘導的沉默複合物（RISC）。
RISC與mRNA的結合與切割：
RISC與外源性基因表達的mRNA的同源區進行特異性結合，並在結合部位切割mRNA。切割位點通常是與siRNA中反義鏈互補結合的兩端。
mRNA的降解與基因表達的抑制：
被切割後的mRNA隨即降解，從而誘發宿主細胞針對這些mRNA的降解反應。由於mRNA的降解或翻譯的抑制，目標基因的表達被有效沉默。
siRNA的放大效應：
siRNA不僅能引導RISC切割同源單鏈mRNA，而且可以作為引物與靶RNA結合，並在RNA聚合酶作用下合成更多新的dsRNA。新合成的dsRNA再由Dicer切割產生大量的次級siRNA，進一步放大RNA干擾（RNAi）的作用，最終將靶mRNA完全降解。
通過這一系列複雜的生物化學反應，siRNA能夠在細胞內實現對特定基因表達的沉默，從而在基因治療、藥物研發等領域展現出巨大的套用潛力。