ZIP加密的原理主要涉及到檔案的壓縮和加密兩個過程。首先，檔案內容會被壓縮，以減小檔案的大小。然後，檔案內容通過加密算法進行加密，常用的加密算法包括AES和Zip 2.0傳統加密（CRC32）算法。
加密算法通常使用一個密鑰，這個密鑰在加密過程中被用來對檔案內容進行加密處理。解密時，需要驗證密碼是否正確，這通常是通過加密前內容的哈希來校驗的。哈希算法是一種將任意長度的內容生成固定長度的字元串的算法，它儘可能地使內容不同時生成的字元串不同，同時無法通過字元串還原原來的內容。因此，如果密鑰正確，解密成功後的內容的哈希字元串應該跟加密前的內容的哈希字元串相同。
需要注意的是，ZIP檔案的格式（後綴名）與加密算法和原理關係不大。另外，有些ZIP檔案可能採用偽加密技術，這種技術通過修改檔案頭的加密標誌位來使檔案打開時顯示需要密碼，但實際上可能並沒有真正的密碼保護。