抗酸染色是一種用於檢測抗酸桿菌（如結核分枝桿菌）的特殊染色方法。
抗酸桿菌的特點是其細胞壁含有大量的脂質和脂肪酸，這使得它們不易被普通染色方法着色，但能夠被抗酸染色法染色。在抗酸染色過程中，分枝桿菌的細胞壁脂質與石炭酸復紅結合成牢固的複合物，這種複合物能夠抵抗3%鹽酸酒精的脫色作用，因此即使脫色，菌體仍能保持紅色。抗酸染色過程通常包括固定標本、加熱染色、脫色、復染等步驟。通過這種方法，抗酸桿菌會呈現紅色或粉紅色，而其他細菌則呈現不同顏色。
抗酸染色在臨牀上主要用於檢測結核分枝桿菌等抗酸桿菌，對於診斷肺結核等具有重要意義。