生物有機肥是一種結合了微生物和有機物質特性的肥料。
這種肥料主要由特定功能的微生物與動植物殘體（如畜禽糞便、農作物秸稈等）製成，經過無害化處理和腐熟過程。生物有機肥不僅含有豐富的有機質和植物必需的氮、磷、鉀等營養元素，還包含了多種微量元素和生物刺激素，為作物提供全面的營養。此外，生物有機肥中含有的特定功能微生物可增強土壤肥力、改良土壤結構、促進根系生長、提高作物對營養的吸收能力，並有助於減少土傳病害和農藥殘留。
與傳統的有機肥料相比，生物有機肥通過生物反應器連續高溫腐熟處理，有害雜菌和害蟲被殺滅，提高了肥料的衛生標準。它也不同於單純的菌肥，而是結合了微生物接種劑和傳統有機肥的雙重優勢。