《假面騎士W》的故事舞台發生在現代與未來的東京。劇集以1枚“串聯鏡之錶盤”為核心，講述了以修瑪吉亞為主要構成的未來世界，在住民與修瑪吉亞的共同努力下，東京發展得更加富饒繁榮。但與此同時，另一面，扭曲的世界也開始發展，這就是“不規則的W”的世界。主角門矢士意外捲入其中，他不僅與傳說中的假面騎士Birth相遇，還見到了未知的敵人。於是，圍繞著一顆神秘的鏡石，一場場激烈的戰鬥即將展開。
此外，故事中還出現了名為“雙重裝置”的設定，即人類與修瑪吉亞之間可以通過這個特殊裝置共享危險瞬間，共同面對危機。這個設定也使得故事更具看點。
如需了解更多詳情，建議觀看原劇集。