在口袋妖怪 聖灰中，玩家首先需要 與博士 對 話，然 後 選 擇 三個精 靈球 進行互 動，之 後就可以 獲得皮卡丘。
遊戲 開始 後，玩家可以 前往常磐市，途中 會遇到野生烈雀， 擊 敗 後可以 獲得一些道具。在常磐市，玩家可以遇到小霞 並 搶走她的 腳踏車，然 後 繼 續 前往目的地。在路上，玩家可能 會遇到烈雀的阻 擋，此 時派出皮卡丘 戰鬥即可。 擊 敗烈雀 後， 鳳王 會出 現。 繼 續前 進到 達常磐森林， 這裡有 許多道具可以收集。玩家 應 該捕捉 一隻 綠毛 蟲 並 讓它 進化，同 時 學 習硬邦邦技能。在森林中， 還 會遇到 一個女孩可以 恢復精 靈的 體力。之 後，玩家 會遇到火箭 隊 並 從他 們 那裡 獲得 經 驗。 擊 敗火箭 隊 後，可以 獲得 電珠 並 給皮卡丘 裝 備上。之 後， 前往水 電 廠上面的道路， 這裡有 許多 敵人需要 戰鬥。在 華 藍市，玩家可以遇到小偷 劇情，然 後 與道 館 館主小霞 對 戰。建 議玩家 將皮卡丘放入 倉 庫， 並提升其等 級至20 級， 寶石海星18 級。 擊 敗小霞 後，火箭 隊 會出 現，再次 擊 敗他 們 後可以 進入 一個屋子，在 這裡可以 繼 續主 線任 務。此外， 這 個屋 子裡 還可以遇到 凱西， 並 撿到技能 機器迷人和神秘力量。完成所有任 務 後， 遊戲就 結束了。