巧克力的保存方法主要取決於室內溫度和溼度。一般來說，巧克力適宜保存在陰涼乾燥的地方，避免陽光直射，溫度最好控制在12到20度，溼度控制在65%以下。如果室內溫度過高，例如超過30度，可以將巧克力用塑料袋密封后放入玻璃或塑料容器中，再放入冰箱冷藏室短暫保存，但應儘快食用。
此外，巧克力應遠離有怪異氣味的地方，因爲巧克力含有較多脂肪，容易吸收氣味。如果巧克力包裝未打開，可以直接放回原包裝中；如果包裝已打開，建議使用保鮮膜或鋁箔紙密封后存放在陰涼乾燥處。對於長期儲存，可以考慮使用紅酒櫃或酒窖等更涼爽、穩定的環境。
需要注意的是，巧克力不宜長期存放在冰箱中，因爲冰箱內的溼氣和溫度變化可能會影響巧克力的質地和風味。購買時應檢查生產日期，儘量購買新鮮的產品，並儘快食用。