《噩夢屋2》的故事圍繞著前傳中倖存者成員“小紅帽”及其倖存者同伴，以及各種類型的恐怖事件展開。具體來說：
* “小紅帽”倖存者同伴經歷了之前恐怖事件的洗禮後，最終從零開始組建了新的倖存者團隊。他們在一起討論要逃到哪裡，結果被一位看似善意的鄰居欺騙，無意間走進了一個非常可怕的房屋，即“噩夢屋2”的主線恐怖故事發生地。
* 在房屋內部，倖存者們發現了各種各樣的恐怖事件。他們經歷了原本在遊戲中的一個玩家的屍變、房屋的幽靈以及一隻邪教組織的瘋狂牧師，這名牧師曾經與恐怖事件的製造者有著千絲萬縷的聯繫。此外，房屋中還有其他的隱藏房間和謎題需要解決。
這個故事旨在通過“噩夢屋2”將玩家重新帶入這個可怕的世界，同時給玩家帶來一個比前作更加豐富、複雜和令人印象深刻的恐怖體驗。同時，玩家可以通過新的故事情節與角色互動，進一步了解這個可怕世界的秘密。