木瓜苦的原因主要包括：
木瓜未成熟。未成熟的木瓜通常含有苦味，因為其中的天然化合物尚未轉化為甜味。成熟的木瓜果肉柔軟，容易碰傷，不利於運輸，因此果農通常會提前採摘，導致木瓜需要經過催熟後食用。
木瓜未清洗乾淨。食用前需去除木瓜的外皮和籽，若果皮去得太薄，靠近外皮的果肉會帶有苦味。木瓜籽和果皮中含有苦味成分。
木瓜變質。如果木瓜存儲不當或處理過程出現問題，可能會被細菌或黴菌等有害物質感染，導致變質和苦味。
木瓜的種類和品種。不同品種的木瓜可能有不同的口感和味道。
此外，木瓜苦還可能是受寄生蟲感染等因素影響。如果木瓜苦，建議根據上述可能的原因進行檢查，如果懷疑是變質導致的苦味，應避免食用以防食物中毒。